东华理工大学目前的一本、二本、硕士、博士、各类重点实验室都在南昌校区。 南昌市有两个校区：一个是原来的广兰大道南昌校区，主要是理工类专业；还有一个是枫林校区主要是文科经管类专业。 2015年11月，东华理工大学“质谱科学与仪器国际联合研究中心”被认定为2015年度国家级国际联合研究中心，这是江西省首个国家级国际联合研究中心，实现我省国家级国际联合研究中心零的突破。 截至2015年4月，学校拥有核资源与环境国家重点实验室培育基地、放射性地质与勘探技术国防重点学科实验室、国际原子能机构参比实验室等12个国家级、省部级重点实验室（工程技术中心、人文社科重点研究基地），以及铀资源勘查与开发协同创新中心和质谱科学与仪器协同创新中心2个江西省“2011协同创新中心”和4个省部级科技创新团队 。