严格生态农业准入制度。古人云：求木之长者，必固其根本；欲流之远者，必浚其泉源。发展生态农业，应从源头入手，提高准入门槛，严格准入制度。为此，应加强分层培训，提高基层党员干部、农业科技推广人员以及广大农民的科技文化素质，在关键岗位实行持证上岗。严把生态农业项目审批关，对有利于节约资源、保护环境的项目发放准入资格证书，对生态环境保护措施评估不达标的项目坚决拒之门外，从源头上防止农业环境污染；对于运营中的生态农业项目，应完善废物排放许可制，实行废物排放总量控制制度；对环保测评不过关，浪费资源、污染环境的项目，按照制度规定坚决叫停和整改。

　　健全农业自然资源资产产权制度和用途管制制度。明晰农业自然资源的产权归属、用途范围、使用责任，是实现生态农业健康发展的前提和基础。为此，应对水流、森林、山岭、草原、荒地、滩涂等农业自然生态空间进行统一确权登记，形成归属清晰、权责明确、监管有效的农业自然资源资产产权制度。建立资源环境承载能力监测预警机制，对水土资源等农业资源超载区域实行限制性措施，健全能源、水、土地节约集约使用制度，建立自然资源、生态环境损害责任终身追究制度。

　　实行农业资源有偿使用和农业生态补偿制度。发展生态农业，应充分发挥市场在资源配置中的决定性作用，根据市场供求、资源稀缺程度、生态环境损害成本和修复效益等，建立使用资源付费和谁污染、谁付费制度，通过这一调节手段有序实现耕地、河湖休养生息。坚持谁受益、谁补偿原则，完善对重点农业生态功能区的生态补偿机制，推动地区间建立横向农业生态补偿制度，完善吸引社会资本投入农业生态环境保护的市场化机制，推行农业环境污染第三方治理制度。