不是，南京站和南京南站不是一个站，二者的主要区别是，车站地址不同、主要线路不同、车站规模内不同。南京站是指南京火车站，位于南京城北，玄武区，玄武湖旁边。

南京南站（NanjingnanRailwayStation）位于江苏省南京市雨花台区，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的客运站，是南京铁路枢纽的重要组成部分，也是华东地区最大的交通枢纽，国家铁道枢纽站，是亚洲第一大火车站和亚洲第一大高铁站。