他克莫司胶囊的主要副作用如下：第一，服用这种药物可能会导致患者抵抗力下降，大大增加病毒、细菌、真菌或原虫感染的风险。第二，对肾脏有一定影响，可能导致血清肌酐升高，血尿素氮升高，尿量减少。第三，它会影响患者的血糖代谢，导致高血糖或糖尿病的发生。第四，对中枢神经系统有一定影响，可表现为头痛、失眠和感觉异常。如果出现上述不适，应及时就医。