食物中毒现多采用的分类方法常见的有以下几种：

（1）细菌性食物中毒：沙门菌属食物中毒、变形杆菌食物中毒、腊样芽胞杆菌食物中毒、致病性大脸杆菌食物中毒、肉毒棱菌食物中毒、酵米面黄杆菌食物中毒、葡萄球菌肠毒素食物中毒、结肠炎耶尔森菌食物中毒、其他细菌性食物中毒。

（2）化学性食物中毒：误食有毒物质或食入被其污染的食物引起的食物中毒，如某些金属、类金属化合物，亚硝酸盐和农药。

（3）有毒动物食物中毒：食入某些有毒动物或动物有毒脏器而引起的食物中毒。某些动物（如鲐鱼等）因贮存不当即产生某些有毒成分，食后亦可引起中毒，如河豚鱼、有毒鱼、贝类。

（4）有毒植物中毒：误食有毒植物或食入因加工不当而未除去有毒成分的某些植物而引起的食物中毒，如毒蕈、木薯、鳞黄花菜、友芽巧铃薯、四季豆、苦杏仁和苔耳子等中毒。

（5）真菌毒素和霉变食品中毒：食用被某些真菌毒索污染的食物而引起的中毒，其污染食物有两种情况，一是谷物在生长、收获、贮存过程中受到真菌污染，真菌在谷物中繁殖并产生毒素；另一种是食物在制作、贮存过程中受到真菌及其毒素的污染，如赤霉病菱中毒、霉变甘蔗中毒、食物中毒性粒细胞减少症等。