胃蛋白酶原I和II在下文中称为PGI和PGII。临床应用PGI与PGI/PGII比值评价胃粘膜萎缩程度。PGI和PGI/PGII普遍降低，表现为胃体萎缩和全胃萎缩。但在胃体萎缩时，胃泌素常增加，而在全胃萎缩时，胃泌素减少。此外，胃窦萎缩时，PGI和PGI/PGII正常，胃泌素降低，是公认的萎缩性胃炎的诊断指标，PGI小于70g/L，PGI/II小于3.0。