生物性危害的等级大多以美国的疾病管制中心（CDC）所规范的四等级为主：

第一级：对于人及动物的危害较轻且对于环境的危害为轻微的，主要措施是接触时要戴上手套，接触后要洗手以及清洗接触过的桌面及器皿等。列于此等级的有枯草杆菌、大肠杆菌、水痘等。

第二级：对于人及动物的危害为中等，对于环境的危害为轻微的。列于此等级的有乙型肝炎、丙型肝炎、流行性感冒、莱姆病、HIV、沙门氏杆菌等等之病原体。

第三级：对于人及动物的危害为高度的，对于环境的危害为轻度的。列于此等级的有炭疽热、疯牛病、SARS、西尼罗河脑炎、天花、结核菌、黄热病等等之病原体。

第四级：对于人及动物的危害为最高的，对于环境的危害为最高的。列于此等级的有伊波拉出血热、登革热、汉他出血热、拉萨热等出血热疾病的病毒。要处理这个等级的生物性危害物质，需要有间合乎第四级标准的实验室（BSL4或P4）来进行，这类实验室要有极严格的门禁管制，且必定为负压隔离，以避免破损时外漏。工作人员与待处理物品必需要做到隔离（如将物品放在负压的手套箱内或是工作人员穿著完整且独立供气的隔离衣）。

另外日本细菌协会订定了三等级的实验室及规范：

第一级病原体：

一般微生物学实验室用，不需特别隔离。

不管制一般访客的进出。

第二级病原体：

一般的病原性微生物实验室使用。

运作时管制一般访客进出。

第三级病原体：

使用双重门且空调系统与外界隔离。

墙壁、天井、工作台等表面要洗净且消毒。

实验室的空气需以高性能的过滤设备（如HEPA）及紫外线杀菌后才可排出。

需要使用负压隔离的实验室。

严格限制列册的工作人员才可依标准程序进出。