京杭大运河山东段主要经过的城市为德州、临清、聊城、济宁、台儿庄地区。

德州市是山东省内第一个运河城市，自从运河开通以后，德州市因为独特的位置，往来商贩无数、游人如织，因为人流密集，也为德州扒鸡的诞生留下了伏笔。德州为古代沿河的四大漕运码头之一，不过因为后期运河改道，造成了码头没落，后来被日军占领以后，德州的漕运码头更是名存实亡。

京杭大运河聊城段，包括聊城段和临清段，这里是明清时期南北方经济文化交流的重要通道，因为漕运发达，这里也留存了大量的名胜古迹，现在已经升级为国家文物保护单位。

济宁在古代的时候名气并不大，城市规模也很小，也是因为京杭运河的兴起才发展为当时的中火花蛤要城市。虽然京杭运河在济宁段只有6.44公里，但是对济宁的影响却特别大。