发票金额大于付款金额，是很常见的事情。

主要有几种： 1、开票方（收款方）优惠，不计零头，但不愿做返利开红票手续； 2、报销人让开票方故意多开，以便报销时可以虚报。账务处理时，应该按实际付款金额入账，发票金额大于付款金额的，不受影响。发票金额小于付款金额的，应该补足发票。从管理上讲，应该严格审核采购项目金额，杜绝上面所讲的第二种情况发生。《国家税务总局关于平销行为征收增值税问题的通知》规定： 1、凡增值税一般纳税人,无论是否有平销行为,因购买货物而从销售方取得的各种形式的返还资金,均应依所购货物的增值税税率计算应冲减的进项税金,并从其取得返还资金当期的进项税金中予以冲减.应冲减的进项税金计算公式如下： 当期应冲减进项税金＝当期取得的返还资金X所购货物适用的增值税税率 2、普通发票，做营业外收入，交所得税。