你好，两个都是三级甲等医院，只是一个军医院，一个公立医院，，其中西南医院拥有国家重点学科10个(烧伤科、肝胆外科、感染病科、泌尿外科、神经外科、骨科、胸心外科、整形外科、心血管内科、呼吸内科)，国家重点培育学科2个(消化内科、眼科)；国家中医药管理局重点学科1个(中西医结合科)，全军医学研究所7个(烧伤科、肝胆外科、感染病科、泌尿外科、消化内科、神经外科、病理科)，全军医学专科、专病中心7个(骨科、眼科、普通外科、检验科、妇产科、心血管内科、康复理疗科)，重医附一院拥有国家重点科室内科学(传染病），神经病学，中西医结合临床，国家临床重点学科老年病科医学影像科肿瘤科产科医学检验科专科护理内分泌科神经外科胸外科麻醉科重症医学科心血管内科眼科神经内科呼吸内科普通外科耳鼻咽喉科由于生殖一般先挂泌尿科，所以建议选择先西南医院，谢谢