如果是县区一级机关单位的公务员改套或晋升而来，毫无疑问需要组织部下文任命。二级主任科员对应正科级，不论是职级并行后由原来的主任科员改套过来，还是由改套后的三级主任科员晋升，在县区一级其管理权限都在县委组织部，而不是单位。换言之，二级主任科员是正儿八经的“县管干部”，提拔晋升不仅需要过县委组织部部务会，还需经县委常委会研究讨论，公示通过后最后由县委组织部下文任命才算走完程序。