主要区别有，地理位置不同、车站规模不同、建设历史不同、主要线路不同，具体如下：

一、地理位置不同

1、徐州东站

位于江苏省徐州市贾汪区。

2、徐州站

江苏省徐州市复兴南路235号。

二、车站规模不同

1、徐州东站

建筑面积45000平方米、站台规模13台28线（截至2019年）。

2、徐州站

建筑面积3.3万平方米、站台规模5台9线（2017年底）。

三、建设历史不同

1、徐州东站

徐州东站于2008年4月18日开建。2011年6月26日，正式投入使用。

2、徐州站

徐州府站始建于1908年6月，由英国建筑师设计。1910年1月，徐州府站建成通车。1927年，徐州府站改名徐州站。1936年，车站又改名铜山站。抗战胜利后车站复名徐州站至今。