主要区别如下：

元数据（metadata）描述数据的数据，对数据及信息资源的描述性信息，大部分属性字段就是元数据。比如，性别，国籍，出生省份等。这个是最接近自然意义的的数据。主数据（MD Master Data）指系统间的共享数据（例如，客户、供应商、账户和组织部门相关数据）。与记录业务活动，波动较大的交易数据相比，主数据（也称基准数据）变化缓慢。在正规的关系数据模型中，交易记录（例如，订单行项）可通过关键字（例如，订单头或发票编号和产品代码）调出主数据。主数据必须存在并加以正确维护，才能保证交易系统的参照完整性。