1、公司与银行签订代发工资协议，银行会给公司一个代发工资的账户，每个月发工资的时候，还是需要填写转账支票的，转账支票的收款单位还是本公司的名称，只是填写进账单的时候，收款人与开户行都是一样的，只是出票人账号是所在银行的原有账号，而收款人的账号则是银行给公司的那个代发工资的账号。

2、另外给银行提供的工资表介质，每个银行是不一样的，有的银行只需要纸质（需加盖本单位的财务章）的工资表就行了，有的银行是需要电子版的，有的银行（比如工行）会给单位财务人员一张光盘及U盾，是专门用于代发工资系统专用的，需要在电脑上把软件装好之后。

3、每个月去银行办理代发工资的时候，把工资表在软件里面转换一下格式，再用U盘把转换格式后工资表拷给银行的工作人员，转换格式后的工资表银行的人与公司的财务人员都是打不开的，银行的工作人员会根据这个表格在后台进行批处理此业务之后，公司所有人员的工资就会全部到达各个人的卡上。