除了作为毕业考试的成绩，学业水平考试的成绩还可以作为高校自主招生的依据。

若报考高职高专，考生可凭高中学业水平考试成绩和综合素质评价结果，直接被依法自主招生的高职高专学校录取。其他实行自主招生的高校，也可根据考生的学业水平考试成绩设定入围条件，不必另外举行笔试。具体对于学生的成绩等要求由招生院校自主划定，市教委核准后对外公布。高中学业水平考试除了作为毕业考试的代替，还是作为高校招生录取的重要参考依据，为兼顾各类高校招生的要求，水平考试“合格”的成绩需要呈现出一定梯度，加以区分。这也是为了让学生有一个自我定位，作为报考高考志愿的参考。普通高中学业水平考试成绩为“不合格”的学生，可由学校组织相应科目的补考。