怀孕40天还没有发现胚芽一般来说是很正常的。我怀第一胎时，也是40天去医院检查，做B超没有发现胚芽，然后医生叫10天以后再去检查，10天后再去检查就发现有胚芽了。

胚芽一般在怀孕40天到50天之间出现，胚芽出现时间不一样是因为每个人的体质都不同，体质不同，每个人的月经周期就不同，有些提前有些推迟，所以胚芽出现时间就不同。受精卵发育晚也会影响胚芽出现时间。

但分泌褐色分泌物可能有点不正常，怀孕出现褐色分泌物要防止先兆流产的发生。

我怀二胎时，也分泌褐色分泌物，后来去医院检查，医生说是先兆流产。但是我那时的B超单上写有液性暗区，而你的没见写有液性暗区，所以应该问题不大。

造成有褐色分泌物的原因也可能是妇科炎症，比如宫颈糜烂等妇科病。

我说的只是可能的情况，具体还需要咨询医生，去医院检查后才能确定原因。

现在你要做的就是注意休息，禁止性生活，避免剧烈运动，不吃生冷食物和容易造成流产的食物，按时产检，听取医生建议。